| 标题 | 深圳地区柯萨奇病毒A16型分子特征分析 |
| 范文 | 黄华鑫 【摘? 要】CVA16（柯萨奇病毒A16），为RNA病毒科肠道病毒属，属于没有包膜单股正链的RNA病毒，是在EV71（肠道病毒71型）之外，导致HFMD（手足口病）疾病的一种主要病原体。鉴于此，本综述为了将手足口病的发病率降低，以深圳地区为例，对CVA16型的分子特点展开综述。 【关键词】柯萨奇病毒;柯萨奇病毒A16;分子特征 CVA16型属于导致疱疹性咽峡、HFMD等疾病的主要病原体，其也能够像EV71导致心肌炎等疾病一样，使HFMD加重，甚至会威胁到患儿的生命健康[1]。因为，对于CVA16型分子来说，VP1蛋白为中和抗原、重要免疫原性蛋白质的决定簇区域，所以，对VP1的区域深入研究，可用于此种病毒进化分析与分子分型当中[2]。本综述，对深圳地区门诊CVA16型展开研究，以掌握深圳地区CVA16型的病毒传播动态、流行病学特点，为深圳预防控手足口病，提供科学与理论依据。 1 CAl6病毒分子的流行病学特点 近些年来，由于肠道病毒，而导致的HFMD疾病发病率，呈逐年上升趋势，在我国一些城市，已经有局部流行情况出现。因为，深圳市属于高人口密度、沿海、流动频繁地区，并且儿童、婴幼儿占比较高，所以，在深圳地区HFM的发病率较高。在对CAl6病毒分子的流行病学特点分析时，使用荧光RT-PCR方式，快速检测，深圳地区全部HFM病例的CAl6病毒，之后选取深圳地区代表性阳性株，用于CAl6特异性的引物，以此RT-PC扩增VPl基因，将阳性扩增[3]。 2 深圳地区CVA16型分子特征 2.1 CVA16在HFMD病例中的分布 通过使用荧光RT-PGR对HFMD病例当中CVA16检测显示，深圳市哨点医院门诊，在2016年到2017年的HFMD阳性样本（1399份）中，CVA16的阳性样本共有271份。在2016年的HFMD阳性样本共有641份，其CVA16的阳性样本有174份，2017年共有758份HFMD阳性样本，其中有97份CVA16阳性样本。 2.2 CVA16在病例中的分布信息 姚相杰等[4]通过对的VP1区氨基酸、核苷酸同源性进行分析，经过实践总结得出，在51株CVA16的病毒株中，核苷酸同源性占到88.1%至100%，氨基酸同源性占比为98.6%到100%，和原型株相比，缺失与插入无碱基。在2016年的CVA16病毒株（28株）中，核苷酸同源性是92.8%到100%，氨基酸的同源性是99.3%至100%，在2017年中，CVA16病毒株核苷酸的同源性占比为88.4%到100%，氨基酸的同源性是98.6%～到100%。在2016年中病毒株JB1416300413、JB1416300399、JB1416300398和2017年的病毒株核苷酸的同源性是100%。 2.3 分析CVA16遗传进化情况 按照核苷酸的序列，使用软件，使用模型、方式，创建51株病毒株，和各个基因型的代表株系统发生树。实践结果显示，2016年深圳CVA16病毒株（28株）类型，都是B亚型B1b亚型，而JB1416300398株，和武汉B1b的代表化，有着十分密切的关系，JB141630375株、JB141630364株，和上海的株具有亲缘的关系剩下的25株和温州市的株、上海市的等为同一个进化分支。 2.4 区的基因分型 周健明等[5]指出，当前CVA16，VP1区的基因分型，还没有统一的标准，当前，共有两种常用方式进行基因分型，（1）A基因型、B基因型、C基因型，其中，C基因型能夠分成C1亚型、C2亚型、C3亚型，这一种基因分型方式，会使B基因型与基因型间的核苷酸，有着较小的差异;（2）本次研究中，所参考的方法，该种方式的基本原则是按照苷酸差异最小是15%，将其分成A基因型、B基因型。可将B基因型分成B1亚型、B2亚型，在2000年之前流程B2亚型，B1亚型在2000年之后流行，B1基因亚型，能够分成B1c、B1b、B1b。深圳龙岗区2017年的CVA16患者中，基因型都属于B1，同时，有共同流行B1a基因亚型、B1b基因亚型，B1b是一种具备优势的基因亚型，同时，和深圳市，以及临省以往流行株，存在着亲缘的关系。在B1a亚型的分支序列当中，一些和我国大陆地区，以往的分离株具有同源性关系，一些和越南、泰国等临近国家毒株存在进化的关系，这一现象可以充分说明了，CVA16具有来源多样性的特点，这和深圳属于重要对外窗口、移民较大城市有着一定的关系。 3 总结 在我国大多数地区，在冬季和夏季是手足口病高发季节。婴幼儿是手足口病的高发群体，而病毒为CVA16型患者的症状较轻。近些年来，CVA16、EV71依旧是导致手足口病出现的一个重要病原。以上对深圳地区CVA16在HFMD分布情况展开分析，从而为帮助深圳地区，预防与治疗手足口病提供科学依据。 参考文献 [1] 王春荣，王春荣，杨国樑，等.2017年济南市柯萨奇病毒A16型VP1基因特征分析[J].中华实验和临床病毒学杂志，2019，33（1）：44. [2] 邓红，冀天娇，黄永迪，等.2012～2016年新疆柯萨奇病毒A6的分子流行病学特征分析[J].病毒学报，2018，34（06）：839-843. [3] 文婕，王鹏飞，李秀芳，等.2015年昆明市柯萨奇病毒A16型VP1区基因特征分析[J].中华疾病控制杂志，2018，22（06）：607-612. [4] 姚相杰，王伟琪，陈龙，等.2016-2017年深圳地区柯萨奇病毒A16型分子特征分析[J].中华微生物学和免疫学杂志，2019，39（9）：652-656. [5] 周健明，邓义州，洪泽涛，等.深圳市龙岗区2017年手足口病病原柯萨奇病毒A16型及肠道病毒71型VP1区基因特征分析[J].实用预防医学，2019，26（03）：371-374. |
| 随便看 |
|
科学优质学术资源、百科知识分享平台，免费提供知识科普、生活经验分享、中外学术论文、各类范文、学术文献、教学资料、学术期刊、会议、报纸、杂志、工具书等各类资源检索、在线阅读和软件app下载服务。