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区分植物种类、探索植物间亲缘关系、阐明植物界自然系统的科学。1903年关庚麟《日本学校图论》:“动植物学科科目……第二年为: 特别问题(随意)、植物分类学、植物解剖及生理实验、有脊动物比较解剖、组织学及发生学实验、生理学、古生物学、临海实验。”
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